Le bulletin de surveillance de Santé publique France publié le 19 octobre 2026 place deux infections sous vigilance à Mayotte. Les virus grippaux sont devenus les plus détectés au laboratoire du centre hospitalier, tandis que l'épidémie de gastro-entérite à rotavirus marque un premier recul. Le territoire reste officiellement en phase pré-épidémique pour la grippe.

Rotavirus : des indicateurs qui refluent, une épidémie toujours en cours

Après trois semaines de hausse, la positivité du rotavirus A recule : 32,6 % en semaine 40, puis 24,8 % en semaine 41, du 5 au 11 octobre, avec 28 prélèvements positifs contre 30 la semaine précédente. L'épidémie, amorcée en semaine 36, n'est pas terminée. D'autres germes digestifs circulent : Escherichia coli entéroagrégatif a été retrouvé dans 43 prélèvements, soit 38,1 % de positivité, et Escherichia coli entéropathogène dans 36 prélèvements, soit 31,9 %.

Au centre hospitalier de Mayotte, les urgences ont comptabilisé 26 passages pour gastro-entérite aiguë en semaine 41, soit 21 % de moins que les 33 de la semaine précédente. Les hospitalisations sont passées de 13 à 9. Un nourrisson de huit mois a toutefois dû être pris en charge en réanimation. Les messages de prévention restent les mêmes : hygiène des mains, nettoyage des surfaces et apports hydriques suffisants en cas de diarrhée ou de vomissements, avec une attention particulière aux signes de déshydratation chez le jeune enfant.

Grippe : A(H1N1) en tête, lecture rendue difficile par la rupture de réactifs

La circulation des virus grippaux a été repérée dès la semaine 30, très en avance sur la saison habituelle de décembre à mars. En semaine 41, ces virus sont devenus majoritaires parmi les prélèvements respiratoires positifs du laboratoire hospitalier, devant les rhinovirus ; le sous-type A(H1N1) domine, avec 17 prélèvements positifs et un taux de positivité de 26,9 %.

Ces chiffres doivent être maniés avec prudence : une rupture de réactifs a interrompu les analyses pendant deux semaines et seuls 63 prélèvements ont été traités à la reprise, contre 123 en semaine 38. Faute de données suffisantes, Santé publique France maintient Mayotte en phase pré-épidémique.

Depuis la semaine 36, les pathologies respiratoires représentent plus de 10 % des consultations dans les centres médicaux de référence et les dispensaires, et deux enfants de moins d'un an ont été admis en réanimation pour une bronchiolite non liée au VRS. La vaccination antigrippale cible en priorité les personnes âgées, les femmes enceintes et les porteurs de certaines maladies chroniques.

Source : Mayotte Hebdo, 20 octobre 2026.