Le virus Shamonda, jusqu'ici décrit chez l'animal seulement, vient d'être retrouvé chez un patient en France. Très immunodéprimé, celui-ci est mort au début du mois d'octobre 2026. Dans un Canal Détox publié le 23 octobre, l'Inserm fait le point sur les éléments connus et rappelle qu'aucun risque n'est identifié pour la population générale.

Un diagnostic obtenu par séquençage

Le virus a été mis en évidence aux Hospices civils de Lyon, chez un malade hospitalisé pour une affection sévère et dont les défenses contre les infections étaient très affaiblies. Ce sont des symptômes neurologiques qui ont conduit les biologistes à lancer des analyses génomiques : le rapprochement des séquences obtenues avec des virus déjà répertoriés a désigné Shamonda, confirmé ensuite sur plusieurs prélèvements réalisés à des dates différentes.

L'Inserm pose d'emblée une limite d'interprétation : retrouver le virus dans l'organisme ne démontre pas, à lui seul, qu'il explique l'ensemble du tableau clinique. Des examens complémentaires doivent préciser sa part éventuelle dans le décès.

Un virus des élevages, transmis par des moucherons

Shamonda appartient au genre Orthobunyavirus. Décrit pour la première fois en 1965 sur des bovins du Nigeria, il a ensuite été retrouvé dans d'autres régions africaines, puis isolé au Japon en 2002. Son arrivée en Europe est récente : l'été 2026, dans des élevages bovins français notamment, après des épisodes de maladie observés dès le mois de juin dans l'Est du pays et une identification du virus fin juillet.

Chez l'animal, ce sont des moucherons du genre Culicoides qui assurent la transmission par leurs piqûres. Les services vétérinaires ne constatent pas de contagion directe notable d'un animal à l'autre, à l'exception d'un passage de la mère vers le fœtus durant la gestation. Les bovins concentrent les cas documentés en Europe, mais des chevaux, des moutons et des chèvres ont aussi été touchés. Pour le patient français, l'hypothèse retenue à ce stade est la piqûre d'un moucheron infecté ; elle reste à confirmer.

À ce jour, les autorités sanitaires n'ont relevé aucun indice de contamination entre personnes. Chez l'animal, il n'existe ni vaccin ni antiviral spécifique : la prévention repose sur la réduction de l'exposition des troupeaux aux moucherons vecteurs. L'Inserm note enfin que ce cas nourrit des récits complotistes, qui prêtent au virus une origine ou une dissémination volontaire sans le moindre élément de preuve.

Source : Inserm, Canal Détox, 23 octobre 2026.